MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16A

Total Repeats: 100

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021515	ATG	2	6	4	9	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021515	GGT	2	6	106	111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021515	TAG	2	6	140	145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021515	TCC	2	6	156	161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_021515	ATTA	2	8	167	174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021515	AGG	2	6	192	197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021515	AGT	2	6	288	293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021515	CTT	2	6	313	318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021515	ATC	2	6	336	341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021515	ATT	2	6	357	362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021515	A	7	7	1910	1916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021515	AT	3	6	1938	1943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021515	T	6	6	1981	1986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021515	ATC	2	6	1996	2001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021515	T	6	6	2004	2009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021515	T	6	6	2024	2029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021515	GTTA	2	8	2047	2054	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021515	AG	3	6	2090	2095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021515	TTTCTA	2	12	2133	2144	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_021515	CTT	2	6	2168	2173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021515	A	6	6	2195	2200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021515	AT	3	6	2218	2223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021515	CAA	2	6	2238	2243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_021515	A	6	6	2314	2319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021515	T	6	6	2347	2352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021515	CCAA	2	8	2395	2402	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_021515	T	8	8	2406	2413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021515	A	6	6	2440	2445	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021515	CCA	2	6	2476	2481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_021515	T	8	8	2516	2523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021515	CTTT	2	8	2550	2557	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_021515	AGTA	2	8	2560	2567	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021515	TTG	2	6	2575	2580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021515	TTG	2	6	2614	2619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021515	CTTCT	2	10	2667	2676	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_021515	ATT	2	6	2695	2700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021515	TGTT	2	8	2734	2741	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021515	TAA	2	6	2778	2783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021515	TTG	2	6	2841	2846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021515	GTTT	2	8	2873	2880	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021515	TCA	2	6	2894	2899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_021515	TAT	2	6	3871	3876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021515	CAC	2	6	4101	4106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_021515	A	6	6	4131	4136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021515	A	6	6	4153	4158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021515	CGTT	2	8	4205	4212	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_021515	CAG	2	6	4421	4426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021515	CAA	2	6	4448	4453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021515	TA	4	8	4520	4527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021515	TAA	2	6	4598	4603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021515	TCT	2	6	4606	4611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_021515	T	6	6	4616	4621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021515	TCA	2	6	4666	4671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_021515	AGCA	2	8	4725	4732	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_021515	TCA	2	6	4735	4740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_021515	CTTT	2	8	4754	4761	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_021515	AAT	2	6	4791	4796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021515	A	6	6	4883	4888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021515	TTAG	2	8	4947	4954	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021515	CAA	2	6	4991	4996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_021515	AGA	2	6	5023	5028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021515	ATTT	2	8	5106	5113	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021515	AATC	2	8	5167	5174	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_021515	TTA	2	6	5221	5226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021515	TGA	2	6	5337	5342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021515	AAT	2	6	5394	5399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021515	T	6	6	5413	5418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021515	TTG	2	6	5429	5434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021515	ATC	2	6	5480	5485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_021515	AGCC	2	8	5527	5534	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_021515	TAAT	2	8	5715	5722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021515	GGAA	2	8	5798	5805	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021515	TGA	2	6	5826	5831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021515	GCA	2	6	5995	6000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_021515	GTT	2	6	6053	6058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021515	TTG	2	6	6116	6121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021515	A	6	6	6139	6144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021515	GGT	2	6	6191	6196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021515	A	7	7	6242	6248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021515	GACGAA	2	12	6267	6278	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_021515	A	6	6	6331	6336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021515	AAG	2	6	6367	6372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021515	TTAA	2	8	6405	6412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021515	TTG	2	6	6439	6444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021515	GAT	3	9	6450	6458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021515	A	6	6	6482	6487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021515	TAT	2	6	6553	6558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021515	TGA	2	6	6559	6564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021515	AGC	2	6	6571	6576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_021515	CAA	3	9	6596	6604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_021515	AAAAC	2	10	6684	6693	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_021515	TGG	2	6	6717	6722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021515	A	6	6	6820	6825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021515	TTAT	2	8	6842	6849	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021515	T	6	6	7030	7035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021515	TCT	2	6	7048	7053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_021515	TAT	2	6	7063	7068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021515	TGT	2	6	7113	7118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021515	GATT	2	8	7177	7184	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021515	GTTT	2	8	7215	7222	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.